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博士申请制指的是在学校所设博士研究生招生计划内的招生，考生需要提供相应的资格条件和申请材料，通过学校的严格审核后方可录取。
申请考核制是指不设博士研究生招生计划，考生可自由选择导师（需符合相关资格条件），完成导师指定的科研项目，项目经过专家审核通过后可毕业。
博士申请制的优点在于能够通过学校的审核，保证学生的学术水平和能力，同时学校会提供一定的经费和资源保障，能够更好地培养学生。
但是博士申请制的缺点也不可忽视，对于那些没有获得学校招生计划内录取机会的申请者来说，竞争非常激烈，容易产生“卡位”现象，失去择优考虑的机会。
申请考核制的优点在于无需通过比较激烈的审核流程，学生可以自由选择导师和研究题目，有更大的自主权，同时也能够在完成任务的过程中获得更为丰富的实践经验。
但申请考核制的缺点也是比较明显的，导师和科研项目的选择非常重要，而且学生需要在没有经济支持的情况下完成研究，同时导师选择失误还会影响学业的进展。
博士申请制还是申请考核制，并没有绝对的优劣之分，取决于申请者的个人经历、兴趣、能力及未来的职业发展方向。如果申请者希望在学术研究领域发展，且对学校自身和导师的支持和资源有较高的要求，可以优先考虑博士申请制。如果申请者在找到感兴趣的导师和研究课题后，希望更加自由灵活地开展研究，更注重实践能力的培养，可以优先考虑申请考核制。
总的来说，博士申请制和申请考核制都有各自的优缺点，对于申请者来说，应根据自己的情况和未来的发展方向来做出选择。
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